Ripartizione spese di frazionamento tra due proprietari.

Beh, ti sei già risposta...
...se non volete fare la metà esatta, si va per quote di proprietà, come da te calcolate.

La consuetudine sarebbe quella di dividere a meta'???
Volevo sottoporre un altro quesito, per il frazionamento abbiamo presentato una Dia, vorrei sapere i tempi tecnici da aspettare per l'accatastamento. Il tutto per poter chiedere la perizia della banca e la relazione notarile ai fini della concessione del mutuo.

Diciamo che non è una consuetudine, ma non puoi considerare il fabbricato diviso in due appartamenti come un condominio, e quindi per quote millesimali.
Nel tuo caso la proprietà sarebbe 1/3 e 2/3. Se non è un problema la divisione a metà, usate tale parametro.

Con la Scia (la Dia non esiste più) i lavori da eseguirsi sono immediati. Alla fine degli stessi, il tecnico che ha redatto il progetto di divisione in due unità immobiliari, dovrà accatastarle.
I tempi sono abbastanza brevi, ma dipendono dal tecnico.
Per il Catasto, se presenti in via telematica la variazione (e non ci sono problemi) entro 2/3 giorni approvano la pratica, se invece la presenti allo sportello l'approvazione è immediata.