1) L'impresa non ha nessun documento che dimostri la tua richiesta di migliorie!
2) Eventuali ritardi nella consegna degli immobili per eseguire queste varianti, non sono congrue in quanto non sono state richieste varianti da parte tua.
3) Che rapporto c'è tra l'importo delle varianti e il valore degli appartamenti oggetto di permuta?
Io ritengo che tu ti possa muovere sin da ora, quantomento informandoti su cosa puoi fare, se gli accordi nel contratto di permuta sono chiari l'impresa deve capire che ha operato a suo esclusivo rischio, pertanto il fatto che tu riconosca le migliorie apportate ed eventualmente gli riconosca un qualche maggior onere deve essere un fatto che parte da una tua volontà e non scontato.
Il aspetterei che i lavori fossero finiti, intendo data la fine lavori, agibilità, accatastamreno, certificati degli impianti ecc. ecc. poi parlerei con l'impresa prima del rogito. Meglio ancora se tu riuscissi a farti dare tutti i certificati degli impianti, del catasto e dell'agibilità, certificazione energetica ecc. ecc.
Questo perché se andate a litigare almento i lavori sono ultimati.
In ogni caso sentirei il parere di un legale.
Potresti anche prendere in considerazione il pagameno parziale di queste opere. Si valuta il loro vero valore di sosto e gli si riconosce solo una parte di questo valore.
Io agirei in questo modo.