In pratica tu hai versato l'importo di 36 euro con causale 112T (imposta di registro anni successivi) invece di versare l'importo di 67 euro con causale 114T (imposta di registro - proroga), giusto ?
Inoltre non hai presentato il modello CDC o 69 nei termini.
Ora mi chiedi se facendo il ravvedimento operoso, ovvero versando i 67 euro con causale 114T relativamente allo stesso contratto tu possa sanare, presentando contestualmente all'Agenzia delle Entrate sia la copia del F23 che il modello CDC o 69 compilato, anche quest'ultimo adempimento.
Io ci proverei, tanto il versamento dei 67 euro devi comunque farlo per poi chiedere il rimborso di quello errato di 36 euro (non dimenticartene, non è giusto lasciargieli).
Presentati all'Agenzia delle Entrate con faccia tosta, con il F23 che dimostra che hai pagato sanzioni e interessi e il mod. CDC o 69 compilato e vedi cosa ti dice il funzionario.
In teoria sono due mancanze distinte (errato versamento e mancata presentazione modello nei termini), per cui non credo che sanando la prima si riaprano i termini però, come ti ripeto, io ci proverei.